Protein–RNA interactions for Protein: P61962

DCAF7, DDB1- and CUL4-associated factor 7, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF7P61962 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCAF7P61962 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms