Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME5P56597 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME5P56597 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NME5P56597 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME5P56597 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME5P56597 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME5P56597 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME5P56597 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME5P56597 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NME5P56597 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME5P56597 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME5P56597 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME5P56597 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NME5P56597 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME5P56597 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME5P56597 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NME5P56597 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME5P56597 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME5P56597 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME5P56597 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME5P56597 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NME5P56597 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME5P56597 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME5P56597 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME5P56597 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME5P56597 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME5P56597 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NME5P56597 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NME5P56597 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NME5P56597 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NME5P56597 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NME5P56597 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NME5P56597 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NME5P56597 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NME5P56597 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NME5P56597 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NME5P56597 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NME5P56597 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NME5P56597 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NME5P56597 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NME5P56597 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NME5P56597 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NME5P56597 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NME5P56597 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NME5P56597 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NME5P56597 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NME5P56597 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NME5P56597 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NME5P56597 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NME5P56597 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NME5P56597 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NME5P56597 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NME5P56597 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NME5P56597 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NME5P56597 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NME5P56597 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NME5P56597 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NME5P56597 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NME5P56597 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NME5P56597 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NME5P56597 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NME5P56597 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NME5P56597 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME5P56597 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME5P56597 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME5P56597 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME5P56597 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME5P56597 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME5P56597 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME5P56597 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME5P56597 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME5P56597 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NME5P56597 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME5P56597 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME5P56597 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME5P56597 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME5P56597 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME5P56597 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME5P56597 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME5P56597 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME5P56597 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME5P56597 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME5P56597 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME5P56597 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME5P56597 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME5P56597 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME5P56597 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME5P56597 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME5P56597 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME5P56597 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME5P56597 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME5P56597 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NME5P56597 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME5P56597 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME5P56597 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME5P56597 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME5P56597 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME5P56597 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME5P56597 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NME5P56597 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms