Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTBP2P56545 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms