Protein–RNA interactions for Protein: P51610

HCFC1, Host cell factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCFC1P51610 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HCFC1P51610 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HCFC1P51610 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HCFC1P51610 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HCFC1P51610 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HCFC1P51610 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HCFC1P51610 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HCFC1P51610 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HCFC1P51610 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HCFC1P51610 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HCFC1P51610 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HCFC1P51610 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HCFC1P51610 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HCFC1P51610 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HCFC1P51610 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HCFC1P51610 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HCFC1P51610 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
HCFC1P51610 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HCFC1P51610 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HCFC1P51610 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
HCFC1P51610 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HCFC1P51610 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HCFC1P51610 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HCFC1P51610 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HCFC1P51610 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HCFC1P51610 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HCFC1P51610 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HCFC1P51610 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HCFC1P51610 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HCFC1P51610 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HCFC1P51610 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HCFC1P51610 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HCFC1P51610 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HCFC1P51610 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HCFC1P51610 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HCFC1P51610 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HCFC1P51610 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
HCFC1P51610 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HCFC1P51610 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HCFC1P51610 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HCFC1P51610 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HCFC1P51610 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HCFC1P51610 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HCFC1P51610 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HCFC1P51610 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HCFC1P51610 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HCFC1P51610 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HCFC1P51610 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HCFC1P51610 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HCFC1P51610 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HCFC1P51610 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HCFC1P51610 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HCFC1P51610 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HCFC1P51610 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HCFC1P51610 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HCFC1P51610 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HCFC1P51610 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HCFC1P51610 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HCFC1P51610 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HCFC1P51610 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HCFC1P51610 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HCFC1P51610 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HCFC1P51610 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
HCFC1P51610 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HCFC1P51610 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
HCFC1P51610 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HCFC1P51610 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HCFC1P51610 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HCFC1P51610 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HCFC1P51610 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HCFC1P51610 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HCFC1P51610 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HCFC1P51610 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HCFC1P51610 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HCFC1P51610 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HCFC1P51610 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HCFC1P51610 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HCFC1P51610 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HCFC1P51610 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HCFC1P51610 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HCFC1P51610 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HCFC1P51610 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HCFC1P51610 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HCFC1P51610 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
HCFC1P51610 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HCFC1P51610 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HCFC1P51610 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HCFC1P51610 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HCFC1P51610 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HCFC1P51610 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HCFC1P51610 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HCFC1P51610 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HCFC1P51610 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HCFC1P51610 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HCFC1P51610 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HCFC1P51610 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HCFC1P51610 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HCFC1P51610 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.05■□□□□ 0
HCFC1P51610 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HCFC1P51610 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms