Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLK1P49759 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLK1P49759 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLK1P49759 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLK1P49759 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLK1P49759 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CLK1P49759 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLK1P49759 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLK1P49759 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLK1P49759 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLK1P49759 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLK1P49759 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLK1P49759 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLK1P49759 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLK1P49759 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLK1P49759 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLK1P49759 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLK1P49759 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CLK1P49759 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CLK1P49759 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLK1P49759 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLK1P49759 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLK1P49759 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLK1P49759 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLK1P49759 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLK1P49759 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLK1P49759 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLK1P49759 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLK1P49759 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLK1P49759 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLK1P49759 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLK1P49759 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLK1P49759 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLK1P49759 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLK1P49759 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLK1P49759 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLK1P49759 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLK1P49759 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLK1P49759 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLK1P49759 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLK1P49759 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLK1P49759 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLK1P49759 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLK1P49759 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLK1P49759 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLK1P49759 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLK1P49759 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLK1P49759 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLK1P49759 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLK1P49759 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLK1P49759 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLK1P49759 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLK1P49759 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLK1P49759 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLK1P49759 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLK1P49759 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLK1P49759 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLK1P49759 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLK1P49759 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLK1P49759 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLK1P49759 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLK1P49759 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLK1P49759 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLK1P49759 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLK1P49759 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLK1P49759 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLK1P49759 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLK1P49759 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLK1P49759 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLK1P49759 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLK1P49759 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLK1P49759 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLK1P49759 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLK1P49759 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLK1P49759 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLK1P49759 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLK1P49759 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLK1P49759 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLK1P49759 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLK1P49759 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLK1P49759 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLK1P49759 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLK1P49759 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLK1P49759 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLK1P49759 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLK1P49759 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLK1P49759 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLK1P49759 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLK1P49759 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLK1P49759 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLK1P49759 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLK1P49759 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLK1P49759 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLK1P49759 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLK1P49759 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLK1P49759 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLK1P49759 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLK1P49759 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLK1P49759 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLK1P49759 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms