Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GGCXP38435 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GGCXP38435 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GGCXP38435 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GGCXP38435 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GGCXP38435 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GGCXP38435 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GGCXP38435 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GGCXP38435 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GGCXP38435 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GGCXP38435 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GGCXP38435 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GGCXP38435 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GGCXP38435 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GGCXP38435 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GGCXP38435 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GGCXP38435 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GGCXP38435 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GGCXP38435 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GGCXP38435 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GGCXP38435 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GGCXP38435 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GGCXP38435 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GGCXP38435 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GGCXP38435 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GGCXP38435 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GGCXP38435 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GGCXP38435 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GGCXP38435 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GGCXP38435 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GGCXP38435 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GGCXP38435 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GGCXP38435 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GGCXP38435 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GGCXP38435 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGCXP38435 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGCXP38435 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGCXP38435 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGCXP38435 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGCXP38435 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGCXP38435 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGCXP38435 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGCXP38435 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GGCXP38435 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGCXP38435 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGCXP38435 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGCXP38435 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGCXP38435 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGCXP38435 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGCXP38435 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGCXP38435 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGCXP38435 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGCXP38435 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GGCXP38435 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGCXP38435 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GGCXP38435 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGCXP38435 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGCXP38435 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGCXP38435 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGCXP38435 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GGCXP38435 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGCXP38435 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGCXP38435 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGCXP38435 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGCXP38435 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGCXP38435 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGCXP38435 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGCXP38435 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGCXP38435 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GGCXP38435 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGCXP38435 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGCXP38435 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGCXP38435 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGCXP38435 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGCXP38435 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGCXP38435 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGCXP38435 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGCXP38435 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGCXP38435 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGCXP38435 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGCXP38435 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGCXP38435 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGCXP38435 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGCXP38435 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGCXP38435 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGCXP38435 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGCXP38435 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGCXP38435 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGCXP38435 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGCXP38435 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGCXP38435 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGCXP38435 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGCXP38435 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGCXP38435 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGCXP38435 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGCXP38435 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGCXP38435 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGCXP38435 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGCXP38435 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GGCXP38435 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms