Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBRP36941 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBRP36941 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBRP36941 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBRP36941 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBRP36941 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBRP36941 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBRP36941 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBRP36941 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBRP36941 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBRP36941 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBRP36941 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBRP36941 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBRP36941 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBRP36941 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBRP36941 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBRP36941 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBRP36941 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBRP36941 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBRP36941 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBRP36941 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBRP36941 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBRP36941 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBRP36941 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBRP36941 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBRP36941 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LTBRP36941 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBRP36941 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBRP36941 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBRP36941 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBRP36941 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBRP36941 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBRP36941 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBRP36941 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBRP36941 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBRP36941 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBRP36941 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBRP36941 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBRP36941 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBRP36941 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBRP36941 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBRP36941 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBRP36941 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBRP36941 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBRP36941 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBRP36941 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBRP36941 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBRP36941 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBRP36941 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBRP36941 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBRP36941 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBRP36941 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBRP36941 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBRP36941 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBRP36941 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTBRP36941 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTBRP36941 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTBRP36941 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTBRP36941 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTBRP36941 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTBRP36941 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTBRP36941 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTBRP36941 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTBRP36941 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTBRP36941 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTBRP36941 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTBRP36941 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTBRP36941 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTBRP36941 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LTBRP36941 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTBRP36941 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTBRP36941 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTBRP36941 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LTBRP36941 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTBRP36941 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTBRP36941 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTBRP36941 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTBRP36941 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTBRP36941 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LTBRP36941 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTBRP36941 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LTBRP36941 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTBRP36941 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTBRP36941 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTBRP36941 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTBRP36941 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTBRP36941 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTBRP36941 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTBRP36941 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTBRP36941 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTBRP36941 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTBRP36941 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTBRP36941 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTBRP36941 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTBRP36941 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTBRP36941 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTBRP36941 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTBRP36941 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTBRP36941 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTBRP36941 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms