Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms