Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms