Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL9P32969 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL9P32969 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL9P32969 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL9P32969 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL9P32969 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL9P32969 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL9P32969 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL9P32969 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL9P32969 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL9P32969 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL9P32969 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL9P32969 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL9P32969 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL9P32969 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL9P32969 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL9P32969 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL9P32969 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL9P32969 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL9P32969 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL9P32969 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL9P32969 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL9P32969 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL9P32969 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL9P32969 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL9P32969 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL9P32969 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL9P32969 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL9P32969 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL9P32969 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL9P32969 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL9P32969 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL9P32969 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL9P32969 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL9P32969 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL9P32969 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL9P32969 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL9P32969 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL9P32969 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL9P32969 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL9P32969 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL9P32969 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL9P32969 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL9P32969 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL9P32969 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL9P32969 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL9P32969 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL9P32969 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL9P32969 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL9P32969 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL9P32969 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL9P32969 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL9P32969 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL9P32969 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL9P32969 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL9P32969 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL9P32969 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL9P32969 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL9P32969 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL9P32969 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL9P32969 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL9P32969 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL9P32969 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL9P32969 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL9P32969 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL9P32969 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL9P32969 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL9P32969 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL9P32969 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL9P32969 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL9P32969 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL9P32969 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL9P32969 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL9P32969 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL9P32969 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL9P32969 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL9P32969 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL9P32969 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL9P32969 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL9P32969 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL9P32969 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL9P32969 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL9P32969 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL9P32969 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL9P32969 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL9P32969 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL9P32969 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL9P32969 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL9P32969 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL9P32969 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL9P32969 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL9P32969 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL9P32969 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL9P32969 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL9P32969 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL9P32969 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL9P32969 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL9P32969 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL9P32969 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL9P32969 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms