Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDC27P30260 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDC27P30260 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDC27P30260 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDC27P30260 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDC27P30260 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDC27P30260 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDC27P30260 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDC27P30260 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDC27P30260 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CDC27P30260 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CDC27P30260 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CDC27P30260 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC27P30260 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC27P30260 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC27P30260 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC27P30260 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC27P30260 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC27P30260 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC27P30260 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC27P30260 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC27P30260 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC27P30260 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC27P30260 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC27P30260 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC27P30260 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC27P30260 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC27P30260 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC27P30260 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC27P30260 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC27P30260 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC27P30260 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC27P30260 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC27P30260 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC27P30260 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC27P30260 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC27P30260 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC27P30260 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC27P30260 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC27P30260 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC27P30260 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC27P30260 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC27P30260 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC27P30260 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC27P30260 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC27P30260 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC27P30260 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CDC27P30260 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC27P30260 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC27P30260 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC27P30260 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC27P30260 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC27P30260 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC27P30260 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC27P30260 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC27P30260 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC27P30260 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC27P30260 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC27P30260 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC27P30260 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC27P30260 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC27P30260 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC27P30260 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC27P30260 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC27P30260 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC27P30260 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC27P30260 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC27P30260 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC27P30260 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC27P30260 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC27P30260 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC27P30260 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC27P30260 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDC27P30260 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC27P30260 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC27P30260 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC27P30260 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC27P30260 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC27P30260 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC27P30260 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC27P30260 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC27P30260 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC27P30260 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC27P30260 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC27P30260 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC27P30260 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC27P30260 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC27P30260 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC27P30260 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC27P30260 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC27P30260 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC27P30260 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC27P30260 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC27P30260 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC27P30260 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC27P30260 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC27P30260 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC27P30260 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC27P30260 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDC27P30260 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms