Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms