Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARID4AP29374 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARID4AP29374 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARID4AP29374 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARID4AP29374 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARID4AP29374 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ARID4AP29374 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARID4AP29374 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ARID4AP29374 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARID4AP29374 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARID4AP29374 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARID4AP29374 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARID4AP29374 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARID4AP29374 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ARID4AP29374 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARID4AP29374 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARID4AP29374 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARID4AP29374 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ARID4AP29374 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARID4AP29374 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARID4AP29374 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARID4AP29374 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARID4AP29374 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARID4AP29374 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARID4AP29374 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARID4AP29374 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARID4AP29374 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARID4AP29374 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARID4AP29374 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARID4AP29374 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARID4AP29374 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARID4AP29374 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARID4AP29374 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ARID4AP29374 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ARID4AP29374 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ARID4AP29374 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ARID4AP29374 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ARID4AP29374 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ARID4AP29374 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms