Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SSFA2P28290 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms