Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCD3P28288 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCD3P28288 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms