Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

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Length 886 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4AP27815 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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