Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTX3P26022 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTX3P26022 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTX3P26022 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTX3P26022 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTX3P26022 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTX3P26022 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTX3P26022 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTX3P26022 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTX3P26022 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTX3P26022 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTX3P26022 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTX3P26022 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTX3P26022 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTX3P26022 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTX3P26022 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTX3P26022 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTX3P26022 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTX3P26022 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTX3P26022 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTX3P26022 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTX3P26022 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTX3P26022 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTX3P26022 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTX3P26022 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTX3P26022 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTX3P26022 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTX3P26022 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTX3P26022 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTX3P26022 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTX3P26022 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTX3P26022 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTX3P26022 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTX3P26022 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTX3P26022 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTX3P26022 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTX3P26022 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTX3P26022 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTX3P26022 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTX3P26022 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTX3P26022 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTX3P26022 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTX3P26022 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTX3P26022 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTX3P26022 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTX3P26022 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTX3P26022 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTX3P26022 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTX3P26022 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTX3P26022 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTX3P26022 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTX3P26022 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTX3P26022 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTX3P26022 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTX3P26022 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTX3P26022 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTX3P26022 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTX3P26022 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTX3P26022 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTX3P26022 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTX3P26022 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTX3P26022 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTX3P26022 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTX3P26022 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTX3P26022 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTX3P26022 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTX3P26022 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTX3P26022 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTX3P26022 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTX3P26022 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTX3P26022 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTX3P26022 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTX3P26022 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTX3P26022 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTX3P26022 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTX3P26022 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTX3P26022 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTX3P26022 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTX3P26022 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTX3P26022 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTX3P26022 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTX3P26022 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTX3P26022 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTX3P26022 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTX3P26022 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTX3P26022 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTX3P26022 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTX3P26022 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTX3P26022 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTX3P26022 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTX3P26022 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTX3P26022 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTX3P26022 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTX3P26022 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTX3P26022 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTX3P26022 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTX3P26022 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTX3P26022 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTX3P26022 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTX3P26022 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms