Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KDELR1P24390 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms