Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA6P23229 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA6P23229 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA6P23229 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA6P23229 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA6P23229 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA6P23229 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA6P23229 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA6P23229 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA6P23229 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA6P23229 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA6P23229 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA6P23229 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA6P23229 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA6P23229 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA6P23229 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA6P23229 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA6P23229 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA6P23229 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA6P23229 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ITGA6P23229 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ITGA6P23229 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA6P23229 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA6P23229 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA6P23229 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA6P23229 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA6P23229 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA6P23229 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA6P23229 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA6P23229 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA6P23229 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA6P23229 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA6P23229 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA6P23229 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA6P23229 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA6P23229 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA6P23229 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA6P23229 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA6P23229 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA6P23229 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA6P23229 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA6P23229 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA6P23229 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA6P23229 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA6P23229 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA6P23229 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA6P23229 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA6P23229 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA6P23229 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA6P23229 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA6P23229 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA6P23229 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ITGA6P23229 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA6P23229 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA6P23229 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA6P23229 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA6P23229 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA6P23229 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ITGA6P23229 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA6P23229 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA6P23229 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA6P23229 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA6P23229 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ITGA6P23229 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ITGA6P23229 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA6P23229 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA6P23229 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA6P23229 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ITGA6P23229 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ITGA6P23229 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA6P23229 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA6P23229 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA6P23229 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA6P23229 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA6P23229 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA6P23229 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA6P23229 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA6P23229 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA6P23229 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA6P23229 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA6P23229 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA6P23229 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA6P23229 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA6P23229 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA6P23229 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA6P23229 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA6P23229 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA6P23229 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA6P23229 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA6P23229 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA6P23229 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA6P23229 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA6P23229 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA6P23229 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA6P23229 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA6P23229 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA6P23229 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA6P23229 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ITGA6P23229 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms