Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms