Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms