Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATF3P18847 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ATF3P18847 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATF3P18847 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATF3P18847 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ATF3P18847 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATF3P18847 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATF3P18847 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATF3P18847 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATF3P18847 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATF3P18847 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATF3P18847 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATF3P18847 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATF3P18847 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATF3P18847 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATF3P18847 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATF3P18847 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATF3P18847 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATF3P18847 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ATF3P18847 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATF3P18847 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATF3P18847 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATF3P18847 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATF3P18847 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATF3P18847 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATF3P18847 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATF3P18847 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATF3P18847 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ATF3P18847 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATF3P18847 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ATF3P18847 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATF3P18847 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATF3P18847 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATF3P18847 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ATF3P18847 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATF3P18847 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATF3P18847 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF3P18847 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF3P18847 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF3P18847 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF3P18847 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF3P18847 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF3P18847 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF3P18847 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF3P18847 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF3P18847 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF3P18847 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF3P18847 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF3P18847 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF3P18847 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF3P18847 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF3P18847 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF3P18847 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF3P18847 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF3P18847 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF3P18847 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF3P18847 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF3P18847 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF3P18847 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF3P18847 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF3P18847 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF3P18847 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF3P18847 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF3P18847 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF3P18847 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF3P18847 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF3P18847 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF3P18847 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF3P18847 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF3P18847 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF3P18847 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF3P18847 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATF3P18847 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATF3P18847 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATF3P18847 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATF3P18847 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATF3P18847 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATF3P18847 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ATF3P18847 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ATF3P18847 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATF3P18847 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATF3P18847 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATF3P18847 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATF3P18847 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATF3P18847 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATF3P18847 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATF3P18847 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF3P18847 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF3P18847 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF3P18847 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF3P18847 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF3P18847 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF3P18847 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF3P18847 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF3P18847 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF3P18847 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF3P18847 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF3P18847 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF3P18847 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF3P18847 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms