Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms