Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAV1P15498 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAV1P15498 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAV1P15498 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAV1P15498 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAV1P15498 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAV1P15498 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAV1P15498 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAV1P15498 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAV1P15498 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAV1P15498 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAV1P15498 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAV1P15498 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAV1P15498 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VAV1P15498 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VAV1P15498 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAV1P15498 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAV1P15498 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAV1P15498 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAV1P15498 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAV1P15498 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAV1P15498 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAV1P15498 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAV1P15498 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAV1P15498 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAV1P15498 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAV1P15498 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAV1P15498 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAV1P15498 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAV1P15498 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAV1P15498 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAV1P15498 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAV1P15498 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAV1P15498 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAV1P15498 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAV1P15498 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAV1P15498 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAV1P15498 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAV1P15498 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAV1P15498 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAV1P15498 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAV1P15498 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAV1P15498 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VAV1P15498 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAV1P15498 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAV1P15498 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAV1P15498 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VAV1P15498 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VAV1P15498 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAV1P15498 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VAV1P15498 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VAV1P15498 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VAV1P15498 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAV1P15498 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAV1P15498 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VAV1P15498 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VAV1P15498 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAV1P15498 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAV1P15498 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VAV1P15498 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAV1P15498 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAV1P15498 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAV1P15498 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAV1P15498 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAV1P15498 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAV1P15498 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAV1P15498 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAV1P15498 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAV1P15498 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAV1P15498 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAV1P15498 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAV1P15498 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAV1P15498 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAV1P15498 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAV1P15498 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAV1P15498 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAV1P15498 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAV1P15498 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAV1P15498 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAV1P15498 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAV1P15498 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAV1P15498 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAV1P15498 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAV1P15498 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAV1P15498 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAV1P15498 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAV1P15498 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAV1P15498 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAV1P15498 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAV1P15498 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VAV1P15498 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VAV1P15498 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VAV1P15498 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VAV1P15498 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VAV1P15498 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VAV1P15498 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VAV1P15498 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VAV1P15498 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAV1P15498 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAV1P15498 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms