Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms