Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RLBP1P12271 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms