Protein–RNA interactions for Protein: P11309

PIM1, Serine/threonine-protein kinase pim-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIM1P11309 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIM1P11309 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIM1P11309 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIM1P11309 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIM1P11309 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIM1P11309 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIM1P11309 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIM1P11309 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIM1P11309 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIM1P11309 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIM1P11309 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIM1P11309 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIM1P11309 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIM1P11309 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIM1P11309 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIM1P11309 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIM1P11309 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIM1P11309 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIM1P11309 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIM1P11309 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIM1P11309 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIM1P11309 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIM1P11309 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIM1P11309 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIM1P11309 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIM1P11309 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIM1P11309 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIM1P11309 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIM1P11309 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PIM1P11309 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIM1P11309 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIM1P11309 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PIM1P11309 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIM1P11309 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIM1P11309 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PIM1P11309 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIM1P11309 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIM1P11309 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIM1P11309 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PIM1P11309 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIM1P11309 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIM1P11309 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIM1P11309 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIM1P11309 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIM1P11309 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIM1P11309 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIM1P11309 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIM1P11309 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIM1P11309 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIM1P11309 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIM1P11309 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIM1P11309 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIM1P11309 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIM1P11309 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIM1P11309 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PIM1P11309 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PIM1P11309 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PIM1P11309 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PIM1P11309 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PIM1P11309 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PIM1P11309 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PIM1P11309 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PIM1P11309 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PIM1P11309 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PIM1P11309 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PIM1P11309 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PIM1P11309 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PIM1P11309 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PIM1P11309 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PIM1P11309 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PIM1P11309 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIM1P11309 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIM1P11309 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIM1P11309 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIM1P11309 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIM1P11309 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PIM1P11309 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PIM1P11309 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PIM1P11309 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIM1P11309 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIM1P11309 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PIM1P11309 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIM1P11309 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIM1P11309 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIM1P11309 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIM1P11309 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIM1P11309 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIM1P11309 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIM1P11309 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIM1P11309 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIM1P11309 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PIM1P11309 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIM1P11309 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PIM1P11309 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PIM1P11309 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIM1P11309 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIM1P11309 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIM1P11309 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIM1P11309 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIM1P11309 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms