Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms