Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms