Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJB1P08034 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJB1P08034 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJB1P08034 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJB1P08034 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJB1P08034 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GJB1P08034 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GJB1P08034 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GJB1P08034 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GJB1P08034 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJB1P08034 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJB1P08034 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJB1P08034 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJB1P08034 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GJB1P08034 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJB1P08034 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJB1P08034 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJB1P08034 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJB1P08034 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJB1P08034 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJB1P08034 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJB1P08034 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJB1P08034 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJB1P08034 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJB1P08034 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJB1P08034 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJB1P08034 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJB1P08034 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJB1P08034 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJB1P08034 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJB1P08034 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJB1P08034 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJB1P08034 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJB1P08034 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJB1P08034 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJB1P08034 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJB1P08034 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJB1P08034 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJB1P08034 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJB1P08034 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJB1P08034 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJB1P08034 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJB1P08034 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJB1P08034 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJB1P08034 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GJB1P08034 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJB1P08034 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJB1P08034 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJB1P08034 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJB1P08034 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJB1P08034 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJB1P08034 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJB1P08034 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJB1P08034 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJB1P08034 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GJB1P08034 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJB1P08034 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GJB1P08034 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB1P08034 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB1P08034 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB1P08034 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB1P08034 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB1P08034 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB1P08034 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB1P08034 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB1P08034 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB1P08034 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB1P08034 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB1P08034 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB1P08034 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB1P08034 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB1P08034 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB1P08034 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB1P08034 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB1P08034 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB1P08034 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB1P08034 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB1P08034 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB1P08034 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB1P08034 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB1P08034 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB1P08034 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB1P08034 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB1P08034 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB1P08034 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB1P08034 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB1P08034 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB1P08034 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB1P08034 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB1P08034 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB1P08034 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB1P08034 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB1P08034 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB1P08034 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB1P08034 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB1P08034 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB1P08034 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB1P08034 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB1P08034 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB1P08034 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms