Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMSP04818 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TYMSP04818 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TYMSP04818 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TYMSP04818 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TYMSP04818 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TYMSP04818 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TYMSP04818 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TYMSP04818 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TYMSP04818 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TYMSP04818 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TYMSP04818 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TYMSP04818 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TYMSP04818 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TYMSP04818 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TYMSP04818 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TYMSP04818 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TYMSP04818 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TYMSP04818 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TYMSP04818 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TYMSP04818 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TYMSP04818 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TYMSP04818 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TYMSP04818 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TYMSP04818 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TYMSP04818 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TYMSP04818 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TYMSP04818 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TYMSP04818 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TYMSP04818 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TYMSP04818 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TYMSP04818 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TYMSP04818 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TYMSP04818 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TYMSP04818 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TYMSP04818 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TYMSP04818 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TYMSP04818 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TYMSP04818 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TYMSP04818 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TYMSP04818 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TYMSP04818 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TYMSP04818 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TYMSP04818 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TYMSP04818 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TYMSP04818 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TYMSP04818 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TYMSP04818 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TYMSP04818 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TYMSP04818 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TYMSP04818 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TYMSP04818 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TYMSP04818 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TYMSP04818 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TYMSP04818 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TYMSP04818 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TYMSP04818 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TYMSP04818 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TYMSP04818 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TYMSP04818 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TYMSP04818 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TYMSP04818 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TYMSP04818 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TYMSP04818 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TYMSP04818 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TYMSP04818 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TYMSP04818 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TYMSP04818 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TYMSP04818 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TYMSP04818 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TYMSP04818 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TYMSP04818 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TYMSP04818 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TYMSP04818 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TYMSP04818 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TYMSP04818 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TYMSP04818 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TYMSP04818 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TYMSP04818 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TYMSP04818 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TYMSP04818 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TYMSP04818 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TYMSP04818 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TYMSP04818 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TYMSP04818 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TYMSP04818 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TYMSP04818 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TYMSP04818 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TYMSP04818 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TYMSP04818 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TYMSP04818 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TYMSP04818 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TYMSP04818 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TYMSP04818 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TYMSP04818 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TYMSP04818 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TYMSP04818 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TYMSP04818 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TYMSP04818 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TYMSP04818 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TYMSP04818 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms