Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F6O75461 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F6O75461 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F6O75461 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F6O75461 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F6O75461 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F6O75461 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F6O75461 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F6O75461 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F6O75461 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F6O75461 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F6O75461 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F6O75461 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F6O75461 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F6O75461 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F6O75461 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F6O75461 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F6O75461 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F6O75461 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F6O75461 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F6O75461 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F6O75461 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F6O75461 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F6O75461 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F6O75461 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F6O75461 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F6O75461 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F6O75461 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F6O75461 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F6O75461 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F6O75461 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F6O75461 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F6O75461 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F6O75461 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F6O75461 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F6O75461 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F6O75461 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F6O75461 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F6O75461 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F6O75461 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F6O75461 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F6O75461 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F6O75461 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F6O75461 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F6O75461 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F6O75461 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F6O75461 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F6O75461 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F6O75461 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F6O75461 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F6O75461 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F6O75461 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F6O75461 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F6O75461 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F6O75461 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F6O75461 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F6O75461 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F6O75461 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F6O75461 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F6O75461 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F6O75461 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F6O75461 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F6O75461 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F6O75461 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F6O75461 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F6O75461 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F6O75461 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F6O75461 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F6O75461 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F6O75461 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F6O75461 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F6O75461 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F6O75461 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F6O75461 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F6O75461 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F6O75461 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F6O75461 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F6O75461 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F6O75461 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F6O75461 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F6O75461 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F6O75461 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F6O75461 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F6O75461 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F6O75461 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F6O75461 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F6O75461 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F6O75461 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F6O75461 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F6O75461 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F6O75461 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F6O75461 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F6O75461 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F6O75461 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F6O75461 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F6O75461 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F6O75461 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F6O75461 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F6O75461 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F6O75461 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms