Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSVO60911 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSVO60911 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSVO60911 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSVO60911 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSVO60911 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSVO60911 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSVO60911 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSVO60911 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSVO60911 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSVO60911 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSVO60911 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSVO60911 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSVO60911 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSVO60911 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSVO60911 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSVO60911 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSVO60911 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSVO60911 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSVO60911 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSVO60911 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSVO60911 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSVO60911 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSVO60911 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSVO60911 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSVO60911 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSVO60911 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSVO60911 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSVO60911 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSVO60911 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSVO60911 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSVO60911 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTSVO60911 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTSVO60911 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTSVO60911 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTSVO60911 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTSVO60911 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTSVO60911 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTSVO60911 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTSVO60911 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTSVO60911 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTSVO60911 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSVO60911 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSVO60911 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSVO60911 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSVO60911 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSVO60911 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSVO60911 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSVO60911 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSVO60911 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSVO60911 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSVO60911 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSVO60911 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSVO60911 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSVO60911 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSVO60911 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSVO60911 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSVO60911 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSVO60911 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSVO60911 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSVO60911 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSVO60911 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSVO60911 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSVO60911 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSVO60911 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSVO60911 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSVO60911 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSVO60911 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSVO60911 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSVO60911 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSVO60911 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSVO60911 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSVO60911 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSVO60911 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSVO60911 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSVO60911 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSVO60911 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSVO60911 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSVO60911 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSVO60911 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSVO60911 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSVO60911 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSVO60911 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSVO60911 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSVO60911 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSVO60911 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSVO60911 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSVO60911 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSVO60911 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSVO60911 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSVO60911 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSVO60911 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSVO60911 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSVO60911 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSVO60911 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSVO60911 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSVO60911 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSVO60911 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSVO60911 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSVO60911 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms