Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMDSO60547 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMDSO60547 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMDSO60547 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMDSO60547 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMDSO60547 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMDSO60547 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMDSO60547 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMDSO60547 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMDSO60547 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMDSO60547 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMDSO60547 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMDSO60547 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMDSO60547 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMDSO60547 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMDSO60547 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMDSO60547 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMDSO60547 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMDSO60547 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMDSO60547 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMDSO60547 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMDSO60547 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMDSO60547 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMDSO60547 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMDSO60547 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMDSO60547 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMDSO60547 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMDSO60547 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMDSO60547 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMDSO60547 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMDSO60547 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMDSO60547 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMDSO60547 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMDSO60547 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMDSO60547 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GMDSO60547 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMDSO60547 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMDSO60547 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMDSO60547 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMDSO60547 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GMDSO60547 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GMDSO60547 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMDSO60547 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMDSO60547 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMDSO60547 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMDSO60547 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMDSO60547 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMDSO60547 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMDSO60547 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMDSO60547 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMDSO60547 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMDSO60547 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMDSO60547 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMDSO60547 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMDSO60547 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMDSO60547 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMDSO60547 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMDSO60547 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMDSO60547 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMDSO60547 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMDSO60547 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMDSO60547 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMDSO60547 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMDSO60547 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMDSO60547 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMDSO60547 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMDSO60547 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMDSO60547 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMDSO60547 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMDSO60547 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMDSO60547 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMDSO60547 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMDSO60547 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMDSO60547 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMDSO60547 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMDSO60547 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMDSO60547 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMDSO60547 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMDSO60547 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMDSO60547 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMDSO60547 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMDSO60547 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMDSO60547 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMDSO60547 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMDSO60547 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMDSO60547 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMDSO60547 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMDSO60547 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMDSO60547 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMDSO60547 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMDSO60547 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMDSO60547 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMDSO60547 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMDSO60547 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMDSO60547 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GMDSO60547 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMDSO60547 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMDSO60547 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMDSO60547 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMDSO60547 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms