Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms