Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms