Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms