Protein–RNA interactions for Protein: O15230

LAMA5, Laminin subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 3,695 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5O15230 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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