Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CEP290O15078 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CEP290O15078 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CEP290O15078 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CEP290O15078 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CEP290O15078 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CEP290O15078 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CEP290O15078 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CEP290O15078 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CEP290O15078 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CEP290O15078 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CEP290O15078 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CEP290O15078 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CEP290O15078 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CEP290O15078 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CEP290O15078 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CEP290O15078 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CEP290O15078 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CEP290O15078 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CEP290O15078 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CEP290O15078 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CEP290O15078 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CEP290O15078 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CEP290O15078 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CEP290O15078 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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CEP290O15078 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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CEP290O15078 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CEP290O15078 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CEP290O15078 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CEP290O15078 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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CEP290O15078 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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CEP290O15078 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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CEP290O15078 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CEP290O15078 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
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CEP290O15078 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CEP290O15078 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CEP290O15078 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CEP290O15078 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP290O15078 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP290O15078 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP290O15078 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP290O15078 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP290O15078 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP290O15078 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP290O15078 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP290O15078 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP290O15078 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP290O15078 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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