Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms