Protein–RNA interactions for Protein: O00507

USP9Y, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YO00507 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP9YO00507 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP9YO00507 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP9YO00507 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP9YO00507 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP9YO00507 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP9YO00507 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP9YO00507 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP9YO00507 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP9YO00507 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP9YO00507 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP9YO00507 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP9YO00507 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP9YO00507 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP9YO00507 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP9YO00507 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP9YO00507 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
USP9YO00507 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP9YO00507 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
USP9YO00507 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP9YO00507 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
USP9YO00507 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP9YO00507 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP9YO00507 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP9YO00507 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP9YO00507 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP9YO00507 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP9YO00507 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP9YO00507 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP9YO00507 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP9YO00507 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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USP9YO00507 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
USP9YO00507 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP9YO00507 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP9YO00507 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP9YO00507 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP9YO00507 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
USP9YO00507 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP9YO00507 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP9YO00507 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP9YO00507 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP9YO00507 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP9YO00507 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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USP9YO00507 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP9YO00507 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP9YO00507 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP9YO00507 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP9YO00507 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP9YO00507 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP9YO00507 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP9YO00507 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP9YO00507 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP9YO00507 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP9YO00507 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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USP9YO00507 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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USP9YO00507 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP9YO00507 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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USP9YO00507 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP9YO00507 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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USP9YO00507 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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USP9YO00507 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP9YO00507 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP9YO00507 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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USP9YO00507 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
USP9YO00507 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
USP9YO00507 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
USP9YO00507 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
USP9YO00507 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
USP9YO00507 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
USP9YO00507 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
USP9YO00507 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
USP9YO00507 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
USP9YO00507 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
USP9YO00507 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
USP9YO00507 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
USP9YO00507 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
USP9YO00507 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP9YO00507 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP9YO00507 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP9YO00507 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP9YO00507 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP9YO00507 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP9YO00507 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP9YO00507 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
USP9YO00507 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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