Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
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