Protein–RNA interactions for Protein: A8MUA0

Putative UPF0607 protein ENSP00000381514, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MUA0 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A8MUA0 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A8MUA0 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A8MUA0 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A8MUA0 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A8MUA0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A8MUA0 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
A8MUA0 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A8MUA0 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A8MUA0 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MUA0 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MUA0 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MUA0 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MUA0 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MUA0 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MUA0 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MUA0 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MUA0 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MUA0 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MUA0 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MUA0 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MUA0 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MUA0 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MUA0 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MUA0 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MUA0 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MUA0 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MUA0 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MUA0 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MUA0 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MUA0 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MUA0 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MUA0 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MUA0 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MUA0 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MUA0 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MUA0 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MUA0 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MUA0 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MUA0 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MUA0 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MUA0 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MUA0 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MUA0 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A8MUA0 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MUA0 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MUA0 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MUA0 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MUA0 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MUA0 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MUA0 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MUA0 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MUA0 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MUA0 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MUA0 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MUA0 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MUA0 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MUA0 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MUA0 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MUA0 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MUA0 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MUA0 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MUA0 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MUA0 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MUA0 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MUA0 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MUA0 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MUA0 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MUA0 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MUA0 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MUA0 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MUA0 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MUA0 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MUA0 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MUA0 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MUA0 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MUA0 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MUA0 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MUA0 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MUA0 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MUA0 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MUA0 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MUA0 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MUA0 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MUA0 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MUA0 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MUA0 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MUA0 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MUA0 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MUA0 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MUA0 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MUA0 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MUA0 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MUA0 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MUA0 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MUA0 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MUA0 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MUA0 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A8MUA0 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A8MUA0 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms