Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
RGPD3A6NKT7 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms