Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFGEF2Q9Y6D5 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms