Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms