Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
POLR1DQ9Y2S0 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms