Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC12A4Q9UP95 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms