Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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