Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms